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※内容は一般的な実務情報の概要のため、最終的な判断は最新の公式情報や専門家への確認を前提にしてください。
先に確認：免税事業者等からの課税仕入れに係る経過措置は、2026年10月1日から70％控除です。防衛特別法人税とは別の制度として確認します。
図解：仕入れの時期で控除割合はどう変わる？
80％控除（終了した期間）
70％控除（現在の期間）
50％控除（今後）
30％控除。2031年10月以降は控除不可。
一般課税での仕入れを前提に、経過措置対象の請求書等と帳簿（経過措置適用の記載を含む）を保存します。一の相手先からの税込仕入合計が年・事業年度1億円を超える部分は対象外（2026年10月1日以後開始の課税期間から）。他の特例や売上対応区分も確認してください。
架空例：10％対象の税込110,000円の課税仕入れでは、税相当額10,000円 × 70％ ＝ 控除7,000円、控除できない部分3,000円。全額控除できる仕入れとの差を示す例で、申告納税額そのものではありません。
まず結論
免税事業者等からの課税仕入れに係る経過措置は、2026年10月1日から70％控除です。防衛特別法人税とは別の制度として確認します。
インボイス：仕入税額控除の経過措置
インボイス制度では、適格請求書発行事業者以外（免税事業者など）からの課税仕入れについて、仕入税額控除を一定割合に制限する経過措置が設けられています。2026年10月からは70％、2028年10月から50％、2030年10月から30％へ段階的に移行し、2031年10月以降は控除できません。
一般課税での仕入れを前提に、経過措置対象の請求書等と帳簿（経過措置適用の記載を含む）を保存します。一の相手先からの税込仕入合計が年・事業年度1億円を超える部分は対象外（2026年10月1日以後開始の課税期間から）。他の特例や売上対応区分も確認してください。
免税事業者との取引が多い場合は、控除割合の変更が仕入コストに影響します。取引先の登録状況の確認や、価格・契約の見直しを早めに検討しておきましょう。
防衛特別法人税の創設
防衛特別法人税は、2026年4月1日以後開始の事業年度から適用されます。基準法人税額から年500万円の基礎控除（短期事業年度は月数按分）を差し引いた課税標準法人税額に4％を乗じます。所得そのものに4％を上乗せする税ではありません。国税庁・申告納付案内（2026年10月18日確認）。
経理の実務対応
- 主要な仕入先・外注先が適格請求書発行事業者かどうかを確認する。
- 免税事業者との取引について、控除割合の変更が及ぼす影響を試算する。
- 会計ソフトの税区分・経過措置の設定が最新かを確認する。
- 防衛特別法人税の影響を、決算・納税予測に織り込む。
FAQ
2026年10月以降の控除割合はいくつですか？
2026年10月1日〜2028年9月30日は70％です。請求書等と帳簿の保存、相手先ごとの適用上限などの条件も確認してください。
免税事業者との取引はやめるべきですか？
一律にやめる必要はありません。控除割合の変化による影響を試算し、取引先との価格・契約の見直しや、登録状況の確認を通じて、総合的に判断するのが実務的です。
防衛特別法人税は中小企業も対象ですか？
法人税額に上乗せされる付加税で、基礎控除額が設けられます。規模の小さい法人への影響は限定的とされますが、自社の法人税額をもとに確認しておきましょう。
参考リンク（公式）
まとめ
2026年は、インボイスの仕入税額控除の経過措置の区切りと、防衛特別法人税の創設が経理に関わります。免税事業者との取引の影響を試算し、会計ソフトの設定や納税予測を見直しましょう。控除割合・税率・時期は変わることがあるため、最終判断は公式情報と税理士の確認を前提にしてください（2026年10月18日確認）。
この記事は一般的な実務情報の提供を目的としています。具体的な税額計算や仕入税額控除の処理は、最新の国税庁の情報および税理士にご確認ください。
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